Objetivos Gerais
Incluem a comparação de genomas de espécies de citros e de seus importantes patógenos, além de ampliar a base de dados sobre miRNAs e processos epigenéticos. O entendimento das relações citros e seus patógenos, a prospecção de genes e promotores, a diversidade genômica do grupo citros com SNPs são aspectos relevantes nessa plataforma.
Responsável pela consolidação das bases de dados sobre genomas e transcriptomas de citros e seus principais patógenos e vetores de doenças. Seu propósito é criar uma ampla base de prospecção de genes, promotores e marcadores genéticos úteis para a compreensão das interações, construção de mapas genéticos e produção de novas cultivares. Nesta Plataforma também são realizados estudos de genomas específicos, como epigenomas e micro RNAs.
Objetivos Específicos
- Ampliar a base de dados de genoma de citros através do resequenciamento de novos genótipos para prospecção de genes espécies-específicos e por marcadores moleculares baseados em SNPs.
- Montar base de dados de SNPs de citros para os trabalhos subsequentes de genotipagem e mapeamento genético.
- Finalizar o sequenciamento dos genomas de fungos patogênicos e fungos endofíticos de citros.
- Finalizar o sequenciamento do genoma do ácaro vetor do vírus da leprose dos citros, Brevipalpus yorthesi (ex phoenicis).
- Ampliar a base de dados de transcriptomas na interação de citros com seus patógenos.
- Ampliar a base de dados de transcriptomas dos fungos patogênicos, endofíticos e oomiceto de citros.
- Sequenciar bibliotecas enriquecidas para miRNa de citros e poncirus.
- Sequenciar bibliotecas epigenômica em tecidos de citros.